All workshops and training opportunities will take place 2–6 August 2021 — the week preceding the AOS & SCO-SOC 2021 Virtual Meeting.

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eBird Status: Working with modeled products in R

2 August 2021; 1:00–2:15 p.m. EDT; 3 August 2021; 1:00–1:45 p.m. EDT
Fee: $0
Maximum Number of Participants: 250
Presenters: Tom Auer, Cornell Lab of Ornithology; Matt Strimas-Mackey, Cornell Lab of Ornithology

The citizen science project eBird has generated a database of almost 1 billion bird observations, with broad spatial and taxonomic coverage. The eBird Status and Trends project uses full-annual cycle machine-learning models with these eBird data and remote-sensing data to account for variation in observer behavior and effort to produce value-added high resolution, weekly estimates of range boundaries, occurrence rate, and relative abundance. In December 2020, the Cornell Lab of Ornithology released visualizations for over 800 species, including over 100 species outside of the Western Hemisphere. In July 2020, the data behind these products will be made publicly available along with the updated ‘ebirdst’ R package developed specifically for analyzing this data. 

This workshop will introduce attendees to the modeling process behind the generation of eBird Status products, the where and how of accessing the data, and a demonstration of how to analyze the modeled products using the ‘ebirdst’ R package. There will be two portions: a) a 1.25 hour Zoom webinar on the first day, consisting of a one-hour lecture and a 15-minute Q&A period for conceptual questions; and b) a 45-minute Q&A Zoom session on the second day for software-related questions and troubleshooting. 

Introduction to statistical inference with count data in R

5–6 August 2021; 1:00–5:00 p.m. EDT
Fee: $10 Professional/$5 Student (region-dependent discounts available)
Maximum Number of Participants: 50
Presenters: Evan Adams, Biodiversity Research Institute; Beth Ross, U.S. Fish and Wildlife Service, Science Applications

Understanding how to think about and analyze count data is a core skill for ornithologists and ecologists. Bird surveys are a common producer of count data. These data are used to conduct species status assessments, build population models, track population trends, and understand spatial variation in density, among many other applications. But count data can be challenging to analyze, and there can be many skills to learn before ecologists effectively use count data to test hypotheses. In this workshop, we propose to show participants how to generate count data then use it to make inferences with linear models, spatial models, and hierarchical models. Participants will learn how to make statistical inferences in R by building statistical models, evaluating model fit, determining parameter performance, and reporting results from a wide range of count-based modeling approaches. The goal of the course is to provide statistical guidance and extensive R code to the participants so they can apply these examples to their work. 

This workshop’s target audience is ecologists familiar with R and data analysis but inexperienced with using R to analyze count data effectively and learn new statistical techniques. All course materials will be available on GitHub for access before and after the workshop.

Joint species distribution models: an introduction to the Bayesian Hierarchical Modeling of Species Communities (HMSC) package in R

THIS WORKSHOP IS CURRENTLY FULL | 2–3 August 2021; 11:00 a.m.–1:00 p.m. EDT; 2:00–4:00 p.m. EDT

Fee: $10 Professional/$5 Student (region-dependent discounts available)
Maximum Number of Participants: 15
Presenters: Ryan C. Burner, Norwegian University of Life Sciences; Luke L. Powell, CiBio

Joint species distribution models (JSDMs) are a powerful way to use trait and phylogenetic information to better estimate species’ response to the environment. They can also be used to estimate species associations, giving insights into community ecology and improving model predictions. The Hierarchical Modeling of Species Communities (HMSC) package in R does this in a spatially explicit and Bayesian hierarchical framework, allowing for statistically sound analyses of data from diverse study designs. After a brief lecture to learn the theoretical basis behind JSDMs (along with a brief introduction to Bayesian methods), participants will start simulating data to analyze and make predictions, becoming comfortable with the workings of the HMSC package. We will then discuss some creative ways the HMSC framework has been used to answer different questions. Finally, participants will have the opportunity to build their own models to explore some real data (or their own). We will do this through a combination of group sessions and smaller breakout rooms where participants can help each other and get more personal feedback from the instructors. For those who want to bring their own data, we will send out some formatting instructions and trial code prior to the workshop, and we will be available to answer formatting questions by email.

This workshop will be suitable for anyone from early-career ecologists to more experienced folks who would like to learn about a versatile and relatively new set of methods. We will provide example code for all exercises, but participants should have at least a basic ability to run code in R. JSDMs are most useful for those working with datasets that include multiple species.

Health Examination and Handling of Wild Psittacines

WORKSHOP CANCELLED | 2–4 August 2021; 4:00–6:00 p.m. EDT

Presenters: Brooke Durham, SoCal Parrot; Sarah Mansfield, SoCal Parrot; Rebecca Miller, SoCal Parrot, Dr. Pat Latas; SoCal Parrot

Wild psittacines are prone to very few health problems where there are no humans. However, humans impact nearly every ecosystem and habitat where parrots exist. In this series of lectures, we will present the common, and usually anthropogenic, injuries and illnesses found in wild parrots. Because humans are also prone to rescuing and caring for wild parrots after they are grounded or confiscated, ornithological professionals may be called upon to assist, whether in the field or at home. We will explore examination, health assessment, suggestions for important data collection, how to find resources to help, and general prognosis for various health issues. Handouts and flowcharts will be available. Safe and humane handling techniques for wild psittacines will be the focus of the hands-on training. The safety of birds and humans with efficient, lower-stress methods is essential when collecting samples that accurately reflect health status. Health examinations, sample collection, microchip implantation, and common health problems will be just a few of the topics and lessons presented with videos of live, wild psittacines in care.

Taking flight: a workshop for ornithologists exploring careers outside academia

4 August 2021; 2:00 –4:00 p.m. EDT
Fee: $10 Professional/$5 Student (region-dependent discounts available)
Maximum Number of Participants: 150
Presenters: Danielle Ethier, Birds Canada; Jennifer Houtz, Cornell University; Colleen Miller, Cornell University; Evan Adams, Biodiversity Research Institute; Ellen Jamieson, High School Educator; Jen Walsh, Cornell University; Nandadevi Cortes, Ithaca College – Smithsonian Institution; Nick Mason, Louisiana State University

A large percentage of ornithologists will work outside of academia, but many are not exposed to the range of jobs available during their education, nor are they prepared to successfully apply to such positions. This workshop will create a forum where attendees can solicit advice on pressing topics relevant to their early-career stage. Our workshop focuses on exposing participants to a diverse range of professional opportunities outside of academia, by pairing early career professionals with a diverse panel of mentors from the following career types: research, education/outreach, communications, policy/advocacy, and resource management.  

Using interactive breakout sessions, we hope to facilitate discussions on professional development topics that may be less transparent to early-career members looking at opportunities outside academics. Specifically, by the end of this workshop, participants will:

  1. Have a broader understanding of career paths available outside academia.
  2. Understand what different job titles really mean, and what to expect on a day-to-day basis.
  3. Identify their transferable skills and how they benefit different job sectors.
  4. Develop an understanding of how to market their skills during the job application process (e.g., resume writing, job interviews).

Each breakout group will build a mock resume with the panelists, which will help participants identify their transferable skills needed for various career types in ornithology. Discussion of different components of the document will also demonstrate the relative importance of different skills and experiences. The organizing committee will synthesize these into a single reference document to be shared with all workshop participants. Translations will also be made available upon request. 

Understanding molt and ageing of passerines using the Howell-Humphrey Parkes and the Wolfe-Ryder-Pyle systems

THIS WORKSHOP IS CURRENTLY FULL | 4 August 2021; 11:00 a.m.–1:00 p.m. EDT
Fee: $10 Professional/$5 Student (region-dependent discounts available)
Maximum Number of Participants: 50
Presenters: Andrea Patterson, Braddock Bay Bird Observatory; Emily Patterson, University of New Hampshire; Sarah Harper Díaz, Sullivan’s Island Bird Banding Station

We will begin by reviewing molts and molt strategies followed by a discussion of the traditional calendar-based Howell-Humphrey-Parkes (HHP) ageing and molt classification system. We will then introduce the cycle-based Wolfe-Ryder-Pyle (WRP) system and compare it to the HHP system. Participants will learn about typical patterns of feather replacement in the pre-formative and pre-basic molts, and about consistent patterns of feather replacement within families and genera. Using a combination of whole-group and small-group hands-on work, students will put these principles into action as they practice locating, documenting, and interpreting molt limits using carefully curated photo arrays.

Customized BBS trends, trajectories, graphs, and maps using the bbsBayes R package

6 August 2021; 11:00 a.m.–1:00 p.m. EDT
Fee: $10 Professional/$5 Student (region-dependent discounts available)
Maximum Number of Participants: 50
Presenters: Brandon Edwards, Carleton University; Adam C. Smith, Environment and Climate Change Canada

This is a 2-hour introductory workshop/demonstration of the R package bbsBayes. This package allows anyone to apply the hierarchical Bayesian models used to estimate status and trends from the North American Breeding Bird Survey. The package also lets the user generate a suite of alternative metrics using the existing model output from the annual CWS analyses.

Participants will be supplied with the necessary materials to follow along with the live coding, getting hands-on experience manipulating model output from the 2019 CWS analysis. 

A full outline will come closer to the date, but the participants will learn how to: 1) download the raw data (including raw data from previous years); 2) stratify the raw data according to stratification methods used by the CWS and choose which species to model; 3) choose from a suite of pre-written hierarchical Bayesian models and run that model (we will not cover formal model-selection, just explore the different model-options); 4) estimate trends for any time period (1970–2019, 2005–2015, 1980–2000, etc.) and graph population trajectories; 5) generate heat maps of population trends; 6) create geofaceted trajectory plots; and 7) estimate trends for customized regions (e.g., all of the eastern Boreal, Great Plains versus eastern populations of grassland birds).


Statut d’eBird: Travailler avec des produits modélisés avec R

2 août 2021; 13 h 00 à 14 h 15 EDT; 3 août 2021; 13 h 00-13 h 45 EDT
Coût: 0
Nombre maximum de participantes et participants: 250
Présentatrices et présentateurs: Tom Auer, Laboratoire en ornithologie de Cornell; Matt Strimas-Mackey, Laboratoire en ornithologie de Cornell

Le projet scientifique d’eBird engage les citoyens a généré une base de données de près d’un milliard d’observations d’oiseaux sur une large échelle spatiale et taxonomique. Le projet “Statut et tendance de données d’eBird” utilise des modèles d’apprentissage automatique qui prennent en compte le cycle annuel et incorporent des données de détection à distance afin de produire des estimations des limites des aires de répartition de façon hebdomadaires et à haute résolution, des estimations du taux d’occurrence et afin de l’abondance relative des populations d’oiseaux, tout en prenant en comptes les variations du comportement et de l’effort des observateurs. En décembre 2020, le laboratoire en ornithologie de Cornell a publié des visualisations de données chez plus de 800 espèces, dont plus de 100 espèces étaient en dehors de l’hémisphère occidental. En juillet 2020, les données à l’origine de ces résultats seront mises à la disposition du public, avec la mise à jour du programme R “ebirdst” développé spécifiquement pour l’analyse de ces données. 

Cet atelier présentera aux participantes et participants le processus de modélisation qui a généré les produits de Statut eBird. Cet atelier présentera également comment et où accéder les données, ainsi que comment analyser les produits modélisés à l’aide de R ‘ebirdst’. Il y aura deux parties dans cet atelier : a) un webinaire Zoom de 1h25 le premier jour, consistant d’une heure d’atelier suivi d’une période de 15 minutes pour les questions-réponses sur les concepts preśentés lors de l’atélier ; et b) une session Zoom de 45 minutes le deuxième jour ouverte aux questions liées au logiciel et la résolution de problèmes.

Introduction à l’inférence statistique avec des données de comptage dans R

5–6 août 2021; 13 h 00 à 16 h 00 EDT
Coût: 10$ pour les professionnelles et professionnels et 5$ pour les étudiantes et étudiants (rabais disponibles selon les régions)
Nombre maximum de participantes et participants: 50
Présentatrices et présentateurs: Evan Adams, Institut de recherche sur la biodiversité; Beth Ross, Service des U.S.A de la pêche et de la faune et flore sauvage, Applications scientifiques 

Comprendre comment penser et analyser les données de comptage est une compétence essentielle pour les ornithologues et les écologistes. Les enquêtes sur les oiseaux sauvages débouchent souvent  sur la collection de données de comptage. Ces données sont utilisées pour évaluer le statut des espèces, construire des modèles de populations sauvages, suivre les tendances des populations sauvages et comprendre la variation spatiale de leur densité. Mais les données de comptage peuvent être difficiles à analyser, et il peut y avoir de nombreuses compétences à acquérir avant que les écologistes utilisent efficacement les données de comptage pour tester des hypothèses. Dans cet atelier, nous proposons de montrer aux participantes  et participants comment générer des données de comptage puis les utiliser pour faire des inférences avec des modèles linéaires, des modèles spatiaux et des modèles hiérarchiques. Les participantes et participants apprendront à faire des inférences statistiques avec R en construisant des modèles statistiques, en évaluant l’ajustement des modèles, en déterminant la performance des paramètres et en rapportant les résultats d’un large éventail d’approches de modélisation basées sur les comptages. L’objectif du cours est de fournir des conseils statistiques et un code R étendu aux participantes et participants afin qu’ils puissent appliquer ces exemples à leur travail. 

Cet atelier cible les écologistes familiarisés avec R et l’analyse de données mais inexpérimentés dans le domaine de l’analyse de données de comptage afin qu’elles ou ils apprennent de nouvelles techniques statistiques. Tous les supports de cet atelier seront disponibles sur GitHub pour un accès avant et après l’atelier.

Modèle de distribution multi-espèces: une introduction à la modélisation hiérarchique bayésienne des communautés d’espèces (HMSC) sur R

2–3 août 2021; 11 h 00 à 13 h 00 EDT; 14 h à 16 h EDT
Coût: 10$ Professionnels/5$ étudiants (des rabais sont disponible en fonction de votre région de provenance) 
Nombre maximum de participants: 15
Présentateurs: Ryan C. Burner, Université norvégienne des sciences de la vie; Luke L. Powell, CiBio

Les modèles de distribution multi-espèces (JSDMs) sont de puissantes façons d’utiliser l’information phylogénétique pour mieux estimer la réponse des espèces à leur environnement. Ces modèles peuvent aussi servir à estimer les associations entre les espèces, permettant des avancées en matière d’écologie des communautés et en améliorant les modèles de prédiction. L’extension  R sur la modélisation hiérarchique des communautés d’espèces (HMSC) permet de réaliser ces estimations de façon spatialement explicite dans un cadre hiérarchique bayésien. Ce modèle permet une analyse de données statistiques valides provenant de différents plans d’études. Suite à une brève lecture théorique sur les bases des JSDMs (accompagnée d’une brève introduction aux méthodes bayésiennes), les participants débuteront en simulant une analyse de données et en effectuant des prédictions. Tout ceci dans le but d’être à l’aise avec le fonctionnement de l’extension HMSC dans R. Nous discuterons ensuite sur les manières créatives que le cadre HMSC fut utilisé pour répondre à différentes questions. Finalement, les participants auront l’opportunité de construire leur propre modèle en utilisant de vraies données (ou leur propres données). Cette séance sera réalisée via une combinaison de sessions de groupes et de rencontres en plus petits groupes répartis dans plusieurs salles. Les participants pourront s’entraider et pourront ainsi avoir des commentaires plus directs des instructeurs. Pour ceux qui souhaitent utiliser leur propres données, des informations vous seront envoyées ainsi qu’un code d’utilisation avant cet atelier. Nous serons également disponibles par e-mail pour les questions plus techniques.

Cet atelier convient à tout le monde, de l’écologiste en début de carrière aux personnes plus expérimentées qui souhaitent en apprendre davantage sur un nouvel ensemble de méthodes versatile. Nous vous fournirons un exemple de code pour tous les exercices, mais les participants devraient au moins posséder des habiletés de bases pour coder avec R. Les JSDMs sont les plus utiles pour ceux qui travaillent avec une base de données multi-espèces.

Examen de santé et manipulations de Psittacidés à l’état sauvage

2-4 août 2021; 16 h 00 à 18 h 00 EDT

Présentateurs: Brooke Durham, SoCal Parrot; Sarah Mansfield, SoCal Parrot; Rebecca Miller, SoCal Parrot, Dr. Pat Latas; SoCal Parrot

Les psittacidés à l’état sauvage sont sujets à très peu de problèmes de santé là où il n’y a pas d’humains. Cependant, les humains ont un impact sur pratiquement tous les écosystèmes et habitats où se trouvent les perroquets. Dans cette série de présentations, nous présenterons les différentes blessures et maladies, à la fois communes et anthropiques, retrouvés chez les perroquets sauvages. Mais, les humains sont également portés à secourir et s’occuper de perroquets sauvages incapables de voler ou confisqués. Ceci-dit, les ornithologues professionnels sont généralement appelés pour de l’assistance sur le terrain ou à la maison. Dans cette séance, nous explorerons les différents examens et bilans de santé et suggestions pour la saisie de données importantes. Il sera également question d’explorer les façons de trouver les ressources aidantes et les pronostiques généraux pour différents problèmes de santé. Des dépliants et des organigrammes seront disponibles. Pour ce qui est de la formation pratique, nous nous concentrerons sur des techniques de manipulations sécuritaires et humaines pour psittacidés sauvages. Il va de soi que pour la collecte d’échantillons reflétant l’état de santé sur des spécimens, des méthodes efficaces, minimisant le stress sont essentielles pour la sécurité des humains et des oiseaux. Bilans de santé, collecte d’échantillons, implantation de micropuces et problèmes de santé communs, ces éléments ne représentent qu’une portion des sujets qui seront présentés sous forme de vidéos en direct de psittacidés sauvages pris en charge.

Prendre son envol : un atelier pour les ornithologues qui envisagent une carrière en dehors du milieu universitaire

4 août 2021; 14 h à 16 h EDT
Coût: 10$ Professionnel/5$ Étudiant (rabais disponibles selon les régions)
Nombre maximal de participants: 150
Conférenciers: Danielle Ethier, Oiseaux Canada; Jennifer Houtz, Cornell University; Colleen Miller, Cornell University; Evan Adams, Biodiversity Research Institute; Ellen Jamieson, Enseignante au secondaire; Jen Walsh, Cornell University; Nandadevi Cortes, Ithaca College – Smithsonian Institution; Nick Mason, Louisiana State University

Un grand pourcentage d’ornithologues travailleront en dehors du milieu universitaire, mais beaucoup d’entre eux ne sont pas exposés à l’éventail d’emplois disponibles pendant leurs études et ne sont pas préparés à postuler avec succès à de tels postes. Cet atelier créera un forum où les participants pourront solliciter des conseils en lien avec leur début de carrière. Notre atelier se concentre sur l’exposition des participants à un large éventail d’opportunités professionnelles en dehors du milieu universitaire, en jumelant des professionnels en début de carrière avec un panel de mentors issus des types de carrière suivants : la recherche, l’éducation/la sensibilisation, les communications, la politique/la défense des intérêts et la gestion des ressources.  

Grâce à des sessions interactives en petits groupes, nous espérons faciliter les discussions sur les sujets touchant le développement professionnel qui peuvent être moins transparents pour les membres en début de carrière qui cherchent des opportunités en dehors du milieu universitaire. Plus précisément, à la fin de l’atelier, les participants pourront :

  1. Avoir une meilleure compréhension des plans de carrière possibles en dehors du milieu universitaire.
  2. Comprendre ce que signifient réellement les différents titres d’emploi et ce à quoi il faut s’attendre au quotidien.
  3. Identifier leurs compétences et la manière dont elles profitent à différents secteurs professionnels.
  4. Développer une compréhension de la façon de promouvoir leurs compétences pendant le processus de demande d’emploi (par exemple, rédaction de C.V., entrevues).

Chaque groupe de discussion élaborera un C.V. fictif avec les panélistes, ce qui aidera les participants à identifier les compétences nécessaires pour divers types de carrière en ornithologie. La discussion des différents éléments du document démontrera également l’importance relative des différentes compétences et expériences. Le comité d’organisation en fera la synthèse dans un document de référence unique qui sera partagé avec tous les participants à l’atelier. Des traductions seront disponibles sur demande.

Comprendre la mue et l’âge chez les passereaux à l’aide des systèmes Howell-Humphrey Parkes et Wolfe-Ryder-Pyle

4 août 2021; 11 h 00 à 13 h 00 EDT
Coût: 10$ Professionnel/5$ Étudiant (rabais disponibles selon les régions)
Nombre maximal de participants: 50
Conférenciers: Andrea Patterson, Braddock Bay Bird Observatory; Emily Patterson, University of New Hampshire; Sarah Harper Díaz, Sullivan’s Island Bird Banding Station

Nous commencerons par une révision des mues et des stratégies de mue, suivie d’une discussion sur le système traditionnel de classification de l’âge et de la mue selon le calendrier Howell-Humphrey-Parkes (HHP). Nous présenterons ensuite le système Wolfe-Ryder-Pyle (WRP) basé sur les cycles et le comparerons au système HHP. Les participants apprendront les modèles typiques de remplacement des plumes lors des mues préformatives et prébasiques, ainsi que les modèles cohérents de remplacement des plumes au sein des familles et des genres. Grâce à une combinaison de travaux pratiques pour tout le groupe et en petits groupes, les étudiants mettront en pratique ces principes en s’exerçant à localiser, documenter et interpréter les limites de mue à l’aide de séries de photos soigneusement sélectionnées.

Tendances, trajectoires, graphiques et cartes BBS personnalisés à l’aide de la bibliothèque R bbsBayes.

6 août 2021; 11 h 00 à 13 h 00 EDT
Coût: 10$ Professionnel/5$ Étudiant (rabais disponibles selon les régions)
Nombre maximal de participants: 50
Conférenciers: Brandon Edwards, Carleton University; Adam C. Smith, Environnement et Changement Climatique Canada

Il s’agit d’un atelier d’introduction/démonstration de deux heures de la bibliothèque R bbsBayes. Cette bibliothèque permet à quiconque d’appliquer les modèles hiérarchiques bayésiens utilisés pour estimer le statut et les tendances du North American Breeding Bird Survey. La bibliothèque permet également à l’utilisateur de générer une série de mesures alternatives en utilisant les résultats du modèle des analyses annuelles du Service Canadien de la Faune (CWS en anglais).

Les participants recevront le matériel nécessaire pour suivre le codage en direct et acquérir une expérience pratique de la manipulation des résultats du modèle provenant de l’analyse de 2019 du CWS.. 

Un aperçu complet sera présenté à l’approche de la date, mais les participants apprendront comment : 1) télécharger les données brutes (y compris les données brutes des années précédentes); 2) stratifier les données brutes selon les méthodes de stratification utilisées par le CWS et choisir les espèces à modéliser; 3) choisir parmi un ensemble de modèles Bayésiens hiérarchiques pré-écrits et exécuter ce modèle (nous ne couvrirons pas la sélection formelle de modèles, nous nous contenterons d’explorer les différentes options de modèles); 4) estimer les tendances pour n’importe quelle période (1970 – 2019, 2005 – 2015, 1980 – 2000, etc.) et produire les trajectoires des populations; 5) générer des cartes thermiques des tendances des populations; 6) créer des graphiques de trajectoires de type « geofaceted »; et 7) estimer les tendances pour des régions données (p. ex, toute la région boréale de l’Est, les populations d’oiseaux de prairie des Grandes Plaines vers de l’Est).


Estatus de eBird: Trabajando con productos modelados en R

2 de agosto de 2021; 1:00–2:15 p.m. EDT; 3 de agosto de 2021; 1:00–1:45 p.m. EDT
Costo: $0
Número máximo de participantes: 250
Presentadores: Tom Auer, Laboratorio de Ornitología de Cornell; Matt Strimas-Mackey, Laboratorio de Ornitología de Cornell

El proyecto de ciencia ciudadana eBird ha generado una base de datos con casi un billón de observaciones de aves, que cuenta con una amplia cobertura espacial y taxonómica. El proyecto “Estatus y tendencias de eBird” usa modelos del ciclo anual completo mediante aprendizaje automatizado con datos de eBird y de sensores remotos para tener en cuenta la variación en el comportamiento y esfuerzo del observador, para así producir estimaciones semanales, de alta resolución y valor agregado, de límites de rango, tasa de ocurrencia y abundancia relativa. En diciembre de 2020, el Laboratorio de Ornitología de Cornell publicó visualizaciones para más de 800 especies, incluyendo más de 100 especies por fuera del hemisferio occidental. En julio del 2020, los datos detrás de estos productos se pondrán a disposición del público junto con el paquete actualizado de R ‘ebirdst’ el cual fue desarrollado de forma específica para analizar estos datos. 

En este taller se introducirá a los asistentes al proceso de modelado detrás de la producción de los productos del Estatus de eBird, el dónde y cómo acceder a los datos, y una demostración de cómo analizar los productos modelados usando el paquete de R ‘ebirdst’. Habrán dos secciones: a) Un seminario web de 1.25 horas via Zoom en el primer día, el cual consistirá de una clase de una hora y un periodo de 15 minutos para preguntas conceptuales; y b) una sesión de preguntas de 45 minutos via Zoom durante el segundo día acerca de dudas relacionadas al software y solución de problemas.

Introducción a la inferencia estadística con datos de conteo en R

5–6 de agosto de 2021; 1:00–4:00 p.m. EDT
Tarifa: $10 Profesional/$5 Estudiante (descuentos disponibles según la región)
Número máximo de participantes: 50
Presentadores: Evan Adams, Instituto de investigación de la biodiversidad; Beth Ross, Servicio de pesca y vida silvestre de EE.UU, Aplicaciones científicas

Entender cómo analizar y  pensar sobre datos de conteo es una habilidad esencial para ornitólogos y ecólogos. Los censos de aves son una actividad que comúnmente produce datos de conteo. Estos datos son usados para generar evaluaciones de estado de las especies, construir modelos de población, rastrear tendencias poblaciones,  entender la variación espacial en densidad y muchas otras aplicaciones. No obstante, los datos de conteo pueden ser difíciles de analizar y existen muchas habilidades para aprender antes de que los ecólogos usen datos de conteo para evaluar hipótesis de forma efectiva. En este taller, nosotros proponemos mostrar a los participantes cómo generar datos de conteo para luego hacer inferencias con modelos lineales, especiales y jerárquicos. Los participantes aprenderán cómo hacer inferencias estadísticas en R mediante la construcción de modelos estadísticos, evaluar el ajuste del modelo, determinar el rendimiento de los parámetros, y a reportar resultados de una amplia gama de enfoques de modelado para datos de conteo. El objetivo del curso es proveer a los participantes con una guía estadística y código de R extenso, para que ellos puedan aplicar estos ejemplos en su trabajo.

La audiencia objetivo de este taller son ecólogos familiarizados con R y análisis de datos, pero con poca o nula experiencia usando R para analizar datos de conteo de forma efectiva y aprendiendo nuevas herramientas estadísticas. Todos los materiales del curso estarán disponibles en GitHub para su acceso antes y después del taller.

Modelos conjuntos de distribución de especies: una introducción al paquete Bayesian Hierarchical Modeling of Species Communities (HMSC) en R

2–3 de agosto de 2021; 11:00 a.m.–1:00 p.m. EDT; 2–4 p.m. EDT
Tarifa: $10 para profesionales/$5 para estudiantes (descuentos disponibles según la región)
Número máximo de participantes: 15
Presentadores: Ryan C. Burner, Universidad Noruega de Ciencias de la Vida; Luke L. Powell, CiBio

Los modelos conjuntos de distribución de especies (JSDM) son una forma poderosa de utilizar la información filogenética y de rasgos para estimar mejor la respuesta de las especies al medio ambiente. También se pueden usar para estimar asociaciones de especies, brindando información sobre la ecología de la comunidad y mejorando las predicciones del modelo. El paquete Hierarchical Modeling of Species Communities (HMSC) en R hace esto en un marco jerárquico bayesiano y espacialmente explícito, lo que permite análisis estadísticamente sólidos de datos de diversos diseños de estudios. Después de una breve conferencia para aprender la base teórica detrás de los JSDM (junto con una breve introducción a los métodos bayesianos), los participantes comenzarán a simular datos para analizar y hacer predicciones, y se familiarizan con el funcionamiento del paquete HMSC. Luego, discutiremos algunas formas creativas en que se ha utilizado el marco HMSC para responder a diferentes preguntas. Finalmente, los participantes tendrán la oportunidad de construir sus propios modelos para explorar algunos datos reales (o los suyos propios). Haremos esto a través de una combinación de sesiones grupales y salas de reuniones más pequeñas donde los participantes pueden ayudarse entre sí y obtener comentarios más personales de los instructores. Para aquellos que quieran traer sus propios datos, les enviaremos algunas instrucciones de formato y un código de prueba antes del taller, y estaremos disponibles para responder preguntas de formato por correo electrónico.

Este taller será adecuado para cualquier persona, desde ecologistas principiantes hasta personas más experimentadas que deseen aprender acerca de un conjunto de métodos versátil y relativamente nuevo. Proporcionaremos un código de ejemplo para todos los ejercicios, pero los participantes deben tener al menos una capacidad básica para ejecutar código en R. Los JSDM son más útiles para quienes trabajan con conjuntos de datos que incluyen múltiples especies.

Examen de salud y manejo de psitácidos silvestres

2–4  de agosto de 2021; 4:00–6:00 p.m. EDT

Presentadores: Brooke Durham, SoCal Parrot; Sarah Mansfield, SoCal Parrot; Rebecca Miller, SoCal Parrot, Dr. Pat Latas; SoCal Parrot

Las psitácidas silvestres son propensas a muy pocos problemas de salud donde no hay humanos. Sin embargo, los humanos impactan en casi todos los ecosistemas y hábitats donde existen los loros. En esta serie de conferencias, presentaremos las lesiones y enfermedades comunes, y generalmente antropogénicas, que se encuentran en los loros salvajes. Debido a que los seres humanos también son propensos a rescatar y cuidar a los loros salvajes después de que son puestos a tierra o confiscados, se puede recurrir a profesionales ornitológicos para ayudar, ya sea en el campo o en casa. Exploraremos exámenes, evaluaciones de salud, sugerencias para la recopilación de datos importantes, cómo encontrar recursos para ayudar y el pronóstico general para varios problemas de salud. Habrá folletos y diagramas de flujo disponibles. Las técnicas de manipulación segura y humana de las psitácidas silvestres serán el foco de la capacitación práctica. La seguridad de las aves y los seres humanos con métodos eficientes y de menor estrés es esencial cuando se recolectan muestras que reflejan con precisión el estado de salud. Los exámenes de salud, la recolección de muestras, la implantación de microchips y los problemas de salud comunes serán solo algunos de los temas y lecciones que se presentan con videos de psitácidas salvajes y en vivo bajo atención.

Tomando vuelo: un taller para ornitólogos que exploran carreras fuera de la academia

4 de agosto de 2021; 24 p.m. EDT
Tarifa: $10 para profesionales/$5 para estudiantes (descuentos disponibles según la región)
Número máximo de participantes: 150
Presentadores: Danielle Ethier, Birds Canada; Jennifer Houtz, Cornell University; Colleen Miller, Cornell University; Evan Adams, Biodiversity Research Institute; Ellen Jamieson, High School Educator; Jen Walsh, Cornell University; Nandadevi Cortes, Ithaca College – Smithsonian Institution; Nick Mason, Louisiana State University.

Un gran porcentaje de ornitólogos trabajará fuera de la academia, pero muchos no están expuestos a la variedad de trabajos disponibles durante su educación, ni están preparados para postularse con éxito a dichos puestos. Este taller creará un foro donde los asistentes pueden solicitar consejos sobre temas urgentes relevantes para la etapa inicial de su carrera. Nuestro taller se enfoca en exponer a los participantes a una amplia gama de oportunidades profesionales fuera de la academia, al emparejar a profesionales de carrera temprana con un panel diverso de mentores de los siguientes tipos de carrera: investigación, educación/divulgación, comunicaciones, políticas/abogacía y gestión de recursos.

Mediante el uso de sesiones de trabajo interactivas, esperamos facilitar las discusiones sobre temas de desarrollo profesional que pueden ser menos transparentes para los miembros que inician su carrera y buscan oportunidades fuera del ámbito académico. Específicamente, al final de este taller, los participantes podrán:

  1. Tener una comprensión más amplia de las trayectorias profesionales disponibles fuera de la academia.
  2. Comprender qué significan realmente los diferentes títulos de trabajo y qué esperar en el día a día.
  3. Identificar sus habilidades transferibles y cómo benefician a los diferentes sectores laborales.
  4. Desarrollar una comprensión de cómo vender sus habilidades durante el proceso de solicitud de empleo (por ejemplo, redacción de currículums, entrevistas de trabajo).

Cada grupo de trabajo creará un currículum vitae simulado con los panelistas, que ayudará a los participantes a identificar sus habilidades transferibles necesarias para varios tipos de carrera en ornitología. La discusión de los diferentes componentes del documento también demostrará la importancia relativa de las diferentes habilidades y experiencias. El comité organizador sintetizará esto en un único documento de referencia para compartir con todos los participantes del taller. Las traducciones también estarán disponibles a pedido.

Comprender la muda y el envejecimiento de los paseriformes utilizando los sistemas Howell-Humphrey Parkes y Wolfe-Ryder-Pyle

4 de agosto de 2021; 11:00 a.m.–1:00 p.m. EDT
Tarifa: $10 para profesionales/$5 para estudiantes (descuentos disponibles según la región)
Número máximo de participantes: 50
Presentadores: Andrea Patterson, Braddock Bay Bird Observatory; Emily Patterson, University of New Hampshire; Sarah Harper Díaz, Sullivan’s Island Bird Banding Station.

Comenzaremos revisando las mudas y las estrategias de muda, seguidas de una discusión del sistema tradicional de clasificación de muda y envejecimiento de Howell-Humphrey-Parkes (HHP) basado en el calendario. Luego, presentaremos el sistema Wolfe-Ryder-Pyle (WRP) basado en ciclos y lo compararemos con el sistema HHP. Los participantes aprenderán sobre patrones típicos de reemplazo de plumas en las mudas preformativas y prebásicas, y sobre patrones consistentes de reemplazo de plumas dentro de familias y géneros. Utilizando una combinación de trabajo práctico en grupos pequeños y con el grupo entero, los estudiantes pondrán en práctica estos principios mientras practican la localización, documentación e interpretación de los límites de la muda utilizando matrices de fotografías cuidadosamente seleccionadas.

Tendencias, trayectorias, gráficos y mapas de BBS personalizados utilizando el paquete bbsBayes en R

6 de agosto de 2021; 11:00 a.m.–1:00 p.m. EDT
Tarifa: $10 para profesionales/$5 para estudiantes (descuentos disponibles según la región)
Número máximo de participantes: 50
Presentadores: Brandon Edwards, Carleton University; Adam C. Smith, Environment and Climate Change Canada

Este es un taller introductorio/demostrativo de 2 horas del paquete bbsBayes en R. Este paquete permite que cualquiera pueda aplicar los modelos bayesianos jerárquicos utilizados para estimar el estado y las tendencias de la Encuesta de Aves Reproductoras de América del Norte. El paquete también permite al usuario generar un conjunto de métricas alternativas utilizando el modelo existente de salida de los análisis anuales de CWS.

Los participantes recibirán los materiales necesarios para realizar la codificación en vivo, obteniendo experiencia práctica en la manipulación de los resultados del modelo del análisis CWS de 2019.

Un esquema completo se hará llegar cerca a la fecha, pero los participantes aprenderán cómo: 1) descargar los datos sin procesar (incluidos los datos sin procesar de años anteriores); 2) estratificar los datos brutos de acuerdo con los métodos de estratificación utilizados por el CWS y elegir qué especies modelar; 3) elegir entre un conjunto de modelos bayesianos jerárquicos preescritos y ejecutar ese modelo (no cubriremos la selección formal del modelo, solo exploraremos las diferentes opciones del modelo); 4) estimar las tendencias para cualquier período de tiempo (1970–2019, 2005–2015, 1980–2000, etc.) y graficar las trayectorias de la población; 5) generar mapas de calor de las tendencias de la población; 6) crear tramas de trayectoria geofacetadas; y 7) estimar las tendencias para las regiones personalizadas (por ejemplo, todas las poblaciones de aves del Boreal oriental, aves de las grandes llanuras versus las poblaciones de aves de pastizales).


Status do eBird: Trabalhando com produtos modelados no R

2 de agosto de 2021; 1:00–2:15 p.m. EDT; 3 de agosto de 2021; 1:00–1:45 p.m. EDT
Taxa: $0
Número máximo de participantes: 250
Palestrantes: Tom Auer, Laboratório de Ornitologia de Cornell; Matt Strimas-Mackey, Laboratório de Ornitologia de Cornell

O eBird  é um projeto de ciência cidadã que tem criado um banco de dados de quase 1 bilhão de observações de aves, com ampla cobertura espacial e taxonômica. O projeto “Status e tendências do eBird” usa modelos de ciclo anual completos mediante aprendizagem de máquina, que utilizam dados do eBird e de sensoriamento remoto e levam em conta a variação entre o comportamento do observador e o esforço desempenhado, para assim construir estimativas semanais dos limites da distribuição, taxas de ocorrência, e abundância relativa. Em dezembro de 2020, o Laboratório de Ornitologia de Cornell publicou visualizações para mais de 800 espécies, incluindo mais de 100 espécies fora do hemisfério ocidental. Em julho de 2020, os dados por trás desses produtos serão disponibilizados publicamente junto com o pacote do R ‘ebirdst’ atualizado, desenvolvido especificamente para analisar esses dados.

Este workshop irá apresentar aos participantes o processo de modelagem por trás da criação dos produtos do Status do eBird , onde e como acessar os dados, e uma demonstração de como analisar os produtos modelados usando o pacote do R ‘ebirdst’. Haverá duas partes: a) um webinário no Zoom no primeiro dia com duração de 1 hora e 15 minutos, consistindo de uma palestra de uma hora e um período de perguntas e respostas de 15 minutos para questões conceituais; e b) uma sessão de perguntas e respostas no Zoom com 45 minutos de duração no segundo dia, para questões relacionadas ao software e solução de problemas.

Introdução à inferência estatística com dados de contagem no R

5–6 de agosto de 2021; 1:00–4:00 p.m. EDT
Taxa: $10 Profissional/$5 Estudante (descontos disponíveis para algumas regiões)
Número máximo de participantes: 50
Palestrantes: Evan Adams, Instituto de Pesquisas em Biodiversidade; Beth Ross, Serviço de Pesca e Vida Selvagem dos Estados Unidos – Programa de Aplicações Científicas 

Compreender como interpretar e analisar dados de contagem é uma habilidade fundamental para ornitólogos e ecologistas. Os levantamentos de avifauna são produtores comuns de dados de contagem. Esses dados são usados para conduzir avaliações do status das espécies, construir modelos populacionais, acompanhar tendências populacionais e compreender a variação espacial na densidade, entre muitas outras aplicações. No entanto, os dados de contagem podem ser difíceis de analisar, e é possível que haja muitas habilidades a serem desenvolvidas antes que os ecologistas usem efetivamente os dados de contagem para testar hipóteses. Neste workshop, propomos mostrar aos participantes como gerar dados de contagem e usá-los para fazer inferências com modelos lineares, modelos espaciais e modelos hierárquicos. Os participantes aprenderão como fazer inferências estatísticas em R construindo modelos estatísticos, avaliando o ajuste do modelo, determinando o desempenho dos parâmetros e relatando os resultados de uma ampla gama de abordagens de modelagem baseadas nesse tipo de contagem. O objetivo do curso é fornecer orientação estatística e códigos do R aos participantes para que possam aplicar esses exemplos ao seu trabalho.

O público-alvo deste workshop são ecologistas que tenham familiaridade com o R e com análise de dados, mas que sejam inexperientes no uso do R para analisar dados de contagem de forma eficaz, podendo assim aprender novas técnicas estatísticas. Todos os materiais do curso estarão disponíveis no GitHub para acesso antes e depois do workshop.

Modelos de distribuição conjunta de espécies: uma introdução ao pacote Bayesian Hierarchical Modeling of Species Communities (HMSC) em R

2–3 de agosto de 2021; 11:00–13:00 EDT; 14:00–1600 EDT
Taxa: $10 Profissional/$5 Estudante (descontos disponíveis de acordo com a região)
Número máximo de participantes: 15
Apresentadores: Ryan C. Burner, Universidade Norueguesa de Ciências da Vida; Luke L. Powell, CiBio

Modelos de distribuição conjunta de espécies (JSDMs, Joint Species Distribution Models) são uma maneira poderosa de usar informações de características e filogenéticas para estimar melhor a resposta das espécies ao ambiente. Eles também podem ser usados ​​para estimar associações de espécies, fornecendo informações sobre a ecologia da comunidade e melhorando as previsões do modelo. O pacote Hierarchical Modeling of Species Communities (HMSC) em R faz isso em uma estrutura hierárquica espacialmente explícita e bayesiana, permitindo análises estatisticamente sólidas de dados de diversos projetos de estudo. Após uma breve palestra para aprender a base teórica por trás dos JSDMs (junto com uma breve introdução aos métodos Bayesianos), os participantes começarão a simular dados para analisar e fazer previsões, para se adaptarem com o funcionamento do pacote HMSC. Em seguida, discutiremos algumas maneiras criativas da estrutura HMSC ter sido usada para responder a diferentes perguntas. Finalmente, os participantes terão a oportunidade de construir seus próprios modelos para explorar alguns dados reais (ou seus próprios). Faremos isso por meio de uma combinação de sessões de grupo e salas menores de apoio, onde os participantes podem ajudar uns aos outros e obter feedback mais pessoal dos instrutores. Para quem quiser trazer seus próprios dados, enviaremos algumas instruções de formatação e código de teste antes do workshop, e estaremos à disposição para responder a perguntas de formatação por e-mail.

Este workshop será adequado para qualquer pessoa, desde ecólogos em início de carreira até pessoas mais experientes que gostariam de aprender sobre um conjunto de métodos versátil e relativamente novo. Forneceremos códigos de exemplo para todos os exercícios, mas os participantes devem ter pelo menos uma habilidade básica para executar códigos em R. JSDMs são mais úteis para aqueles que trabalham com conjuntos de dados que incluem várias espécies.

Exame de saúde e manuseio de psitacídeos selvagens

2–4 de agosto de 2021; 16:00–18:00 EDT

Apresentadores: Brooke Durham, SoCal Parrot; Sarah Mansfield, SoCal Parrot; Rebecca Miller, SoCal Parrot, Dr. Pat Latas; SoCal Parrot

Os psitacídeos selvagens são propensos a poucos problemas de saúde onde não existem humanos. No entanto, os humanos afetam quase todos os ecossistemas e habitats onde os papagaios existem. Nesta série de palestras, apresentaremos as lesões e doenças comuns, e geralmente antropogênicas, encontradas em psitacídeos selvagens. Como os humanos também estão propensos a resgatar e cuidar de psitacídeos selvagens depois que eles são presos ou confiscados, ornitólogos podem ser chamados para ajudar, seja no campo ou em casa. Exploraremos exames, avaliações de saúde, sugestões para coleta de dados importantes, como encontrar recursos para ajudar e prognóstico geral para vários problemas de saúde. Folhetos e fluxogramas estarão disponíveis. Técnicas de manuseio seguras e humanas para psitacídeos selvagens serão o foco do treinamento prático. A segurança de pássaros e humanos com métodos eficientes de baixo estresse é essencial ao coletar amostras que reflitam com precisão o estado de saúde. Exames de saúde, coleta de amostras, implantação de microchip e problemas de saúde comuns serão apenas alguns dos tópicos e lições apresentados com vídeos de psitacídeos selvagens ao vivo sob cuidados.

Decolando: um workshop para ornitólogos explorando carreiras fora da academia

4 de agosto de 2021; 14:00–16:00 EDT
Taxa: $10 Profissionais / $5 estudantes (descontos disponíveis de acordo com a região)
Número máximo de participantes: 150
Apresentadores: Danielle Ethier, Birds Canada; Jennifer Houtz, Cornell University; Colleen Miller, Cornell University; Evan Adams, Biodiversity Research Institute; Ellen Jamieson, High School Educator; Jen Walsh, Cornell University; Nandadevi Cortes, Ithaca College – Smithsonian Institution; Nick Mason, Louisiana State University

Uma grande porcentagem dos ornitólogos irá trabalhar fora da academia, entretanto, durante o período acadêmico, muitos deles não são expostos à variedade de trabalhos disponíveis e não são preparados para se candidatar com sucesso a essas vagas. Esse workshop criará um fórum onde os participantes poderão pedir conselhos sobre assuntos importantes, relevantes para esse período inicial da carreira. Nosso workshop foca em expor aos participantes uma diversa gama de oportunidades fora da academia, através do pareamento de profissionais em início de carreira com um diverso grupo de mentores, nos seguintes tipos de carreira: pesquisa, educação/divulgação, comunicação, política/advocacia e gestão de recursos.  

Utilizando quebras de seção interativas (salas), esperamos facilitar as discussões em tópicos de desenvolvimento profissional, que podem ser menos evidentes para profissionais em início da carreira que estejam buscando oportunidades fora da academia. 

Especificamente, ao fim deste workshop, os participantes irão:

1. Ter uma compreensão mais ampla sobre as trajetórias de carreira disponíveis fora da academia. 

2. Compreender o que realmente significam os diferentes cargos de trabalho, e o que esperar no dia a dia. 3. Identificar suas habilidades transferíveis e como elas beneficiam diferentes setores de trabalho.

4. Desenvolver compreensão de como “vender” suas habilidades durante um processo de seleção de trabalho (ex: escrita do currículo, entrevista de emprego).

Cada grupo de trabalho construirá um modelo de currículo com os organizadores do workshop, que ajudarão os participantes a identificar suas habilidades transferíveis que são necessárias em vários tipos de carreiras dentro da ornitologia. Discussões acerca dos diferentes componentes desse documento também irão demonstrar a importância de diferentes habilidades e experiências. Os organizadores irão então sintetizar os documentos criados em um único documento de referência, que será compartilhado com todos os participantes do workshop. Traduções também serão disponibilizadas sob solicitação.

Compreendendo as mudas e a idade de passeriformes, utilizando os sistemas “Howell-Humphrey Parkes” e “Wolfe-Ryder-Pyle” 

4 de agosto de 2021; 11:00–13:00 EDT
Taxa: $10 Profissionais/$5 Estudantes (descontos disponíveis de acordo com a região)
Número máximo de participantes: 50
Apresentadores: Andrea Patterson, Braddock Bay Bird Observatory; Emily Patterson, University of New Hampshire; Sarah Harper Díaz, Sullivan’s Island Bird Banding Station

Começaremos revisando mudas e estratégias de muda e seguiremos a uma discussão sobre o sistema tradicional de classificação de muda e idade de “Howell-Humphrey-Parkes” (HHP), baseado em calendário. Iremos então apresentar o sistema de “Wolfe-Ryder-Pyle” (WRP), baseado em ciclos, e compará-lo ao sistema HHP. Os participantes aprenderão sobre os padrões típicos de substituição de penas nas mudas pré-formativas e pré-básicas e sobre padrões consistentes de substituição de penas em famílias e gêneros de aves.  Utilizando uma combinação de trabalho prático em grupos pequenos e com o grupo todo, os estudantes irão colocar esses princípios em prática, localizando, documentando e interpretando os limites de muda, com a utilização de matrizes fotográficas cuidadosamente selecionadas.

Tendências, trajetórias, gráficos e mapas BBS personalizados, utilizando o pacote R bbsBayes

6 de agosto de 2021; 11:00–13:00 EDT
Taxa: $10 Profissionais/$5 Estudantes (descontos disponíveis de acordo com a região)
Número máximo de participantes: 50
Apresentadores: Brandon Edwards, Carleton University; Adam C. Smith, Environment and Climate Change Canada

Este é um workshop introdutório/demonstrativo de 2 horas do pacote R bbsBayes. Esse pacote permite que qualquer pessoa aplique os modelos Bayesianos hierárquicos, utilizados para estimar o status e as tendências do projeto “North American Breeding Bird Survey” (Avaliação da reprodução de aves norte-americanas). O pacote também permite que o usuário gere um conjunto de métricas alternativas, utilizando o modelo final existente nas análises anuais de CWS. 

Os participantes receberão os materiais necessários para acompanhar o código R, obtendo experiência prática na manipulação dos modelos finais da análise CWS de 2019. 
Um esquema completo será disponibilizado mais próximo da data do workshop, mas os participantes irão aprender a: 1) baixar os dados não tratados (incluindo dados de anos anteriores); 2) estratificar os dados não processados de acordo com a metodologia de estratificação utilizada pelo CWS e escolher quais espécies modelar; 3) escolher dentre um conjunto de modelos Bayesianos hierárquicos e rodar o modelo (não abordaremos seleção de modelos em si, apenas exploraremos as diferentes opções de modelos); 4) estimar tendências para qualquer período (1970–2019, 2005–2015, 1980–2000, etc.) e plotar gráficos de trajetórias populacionais; 5) gerar mapas de calor das tendências populacionais; 6) criar plots de trajetória geofacetada; e 7) estimar tendências para regiões de interesse (ex: todo o leste Boreal, populações de aves de campo das Grandes Planícies versus populações do leste).

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