Ateliers et possibilités de formation

Les ateliers et les sessions de formation de l'AM & SCO-SOC 2023 offrent des opportunités à la fois pour des exercices d'apprentissage pratiques, où les participants s'engagent dans un mélange de conférences et d'activités, et pour des discussions de groupe sur un large éventail de sujets d'actualité mettant en évidence des avancées passionnantes dans la recherche ornithologique, la gestion, la justice sociale, l'éducation et la conservation.

Tous les ateliers sont programmés pour le mardi 8 août 2023..

Si vous avez des questions, veuillez envoyer un courriel à meeting@americanornithology.org.

bbsBayes2 - Un package R mis à jour et amélioré pour des analyses personnalisées des données du North American Breeding Bird Survey.

Mardi 8 août, de 8h00 à 11h00 (ET)

Participant professionnel ou professionnel débutant : $10.00
Étudiant ou participant d'un pays spécial : $5.00

Nombre maximum de participants: 30

Instructeurs: Adam C. Smith (Service canadien de la faune, Environnement et Changement climatique Canada), Brandon Edwards (Université Carleton), Steffi LaZerte (Université Brandon)

bbsBayes2 est un package R entièrement reconstruit (remplaçant bbsBayes), pour ajuster les modèles bayésiens hiérarchiques utilisés pour estimer le statut et les tendances à partir du North American Breeding Bird Survey (enquête sur les oiseaux nicheurs en Amérique du Nord). Ce nouveau package fournit une meilleure estimation des paramètres en utilisant Stan, des modèles spatialement explicites bien adaptés à l'exploration des modèles spatiaux dans les tendances, un flux de travail rationalisé, la possibilité d'utiliser des stratifications personnalisées, et des fonctions avancées pour aider à la validation croisée et aux comparaisons de modèles. Les participants recevront le matériel nécessaire pour suivre le codage en direct, ce qui leur permettra d'acquérir une expérience pratique de la manipulation et de la visualisation des résultats d'une série de modèles et d'espèces. Les instructeurs démontreront les fonctions du paquet et répondront aux questions, et les participants apprendront comment : 1) télécharger les données brutes du BBS (y compris les données des années précédentes) ; 2) préparer les données pour la modélisation ; 3) choisir parmi une série de modèles bayésiens hiérarchiques intégrés et accéder à des outils pour aider à la validation croisée et à la comparaison des modèles ; 4) estimer les tendances pour n'importe quelle période (1970-2019, 2005-2015, 1980-2000, etc.) et tracer les trajectoires des populations ; 5) générer des cartes thermiques des tendances des populations ; 6) estimer les tendances pour des régions personnalisées (par exemple, l'ensemble de la région boréale de l'Est, l'ensemble de la région boréale de l'Ouest, l'ensemble de la région boréale de l'Ouest, etc, l'ensemble de la région boréale orientale, les Grandes Plaines par rapport aux populations orientales d'oiseaux des prairies) ; et 7) accéder aux principaux modèles de Stan et les personnaliser afin de modifier les a priori ou d'ajouter des covariables (par exemple, des mesures climatiques annuelles ou la couverture végétale).

Compensation de la détectabilité pour combiner les données d'enquêtes provenant d'études indépendantes sur les oiseaux

Mardi 8 août, de 8h00 à 11h00 (ET)

Participant professionnel ou professionnel débutant : $10.00
Étudiant ou participant d'un pays spécial : $5.00

Nombre maximum de participants: 50

Instructeurs: Lionel F. V. Leston (Département des sciences biologiques de l'Université de l'Alberta), Elly C. Knight (Projet de modélisation de l'avifaune boréale)

Il existe un nombre croissant de milliers d'enquêtes sur les oiseaux, y compris des observations scientifiques communautaires (par exemple, eBird), des études indépendantes à court terme, des programmes de surveillance à long terme (par exemple, le North American Breeding Bird Survey) et des données acoustiques collectées avec des unités d'enregistrement autonomes (ARU). L'intégration des données d'enquêtes provenant d'études indépendantes sur plusieurs décennies permet de développer des modèles de distribution des espèces sur de grandes étendues spatiales et temporelles. Cependant, le calendrier saisonnier et journalier des études, les méthodes d'étude, l'habitat environnant les études et les caractéristiques des vocalisations des espèces affectent tous la probabilité de détecter des oiseaux individuels. Le projet de modélisation de l'avifaune boréale a développé des méthodes de calcul des décalages statistiques dans R (c.-à-d. la méthode "QPAD"), qui tiennent compte de ces influences sur la détectabilité. Depuis 2018, ces décalages peuvent être utilisés dans de nombreux types de modèles afin d'intégrer des données d'enquêtes provenant d'études indépendantes dans la même analyse. Les prédictions des modèles avec des décalages QPAD consistent en des densités (mâles / ha), ce qui permet d'estimer la population. Le code a été mis à jour pour tenir compte de facteurs supplémentaires affectant la détection des espèces, y compris la détectabilité accrue de la surveillance acoustique passive. Nous présenterons aux participants la théorie de base de QPAD et des compensations statistiques et nous leur montrerons comment calculer ces compensations et les appliquer dans des analyses statistiques. Les participants apprécieront la puissance de l'intégration des données et des outils pour l'appliquer dans leur propre travail.

Modèles de population intégrés

Mardi 8 août, Heure 8:00 - 17:00 ET

Participant professionnel ou professionnel débutant : $10.00
Étudiant ou participant d'un pays spécial : $5.00

Nombre maximum de participants: 100

Instructeur: Todd W. Arnold (Université du Minnesota)

L'atelier commencera par un bref exposé sur les avantages potentiels de la modélisation intégrée des populations (IPM), avec un très bref aperçu de l'analyse bayésienne utilisant JAGS à travers le programme R. Trois courtes sections se concentreront sur les composants les plus courants des modèles intégrés de population pour les oiseaux : 1) données d'abondance (par exemple, séries chronologiques de données BBS ou autres données de comptage), 2) estimations de fécondité à partir de la surveillance des nids ou des rapports d'âge, et 3) estimations de survie à partir de données de marquage-recapture ou de récupération des bandes. Chacune de ces sections consistera en une présentation PowerPoint d'environ 15 minutes suivie immédiatement de démonstrations pratiques d'analyse de données dans JAGS. Les participants recevront un code de travail qui démontre des approches de plus en plus sophistiquées pour l'analyse des données du monde réel, y compris plus d'exemples que nous ne pourrons en traiter. Le code est conçu pour être adaptable et flexible afin d'accommoder les ensembles de données typiques auxquels les participants auront probablement accès. Même si les participants ne travaillent jamais avec des IPM, les approches bayésiennes des ensembles de données des composants devraient s'avérer très utiles. La dernière section, consacrée à la construction de modèles intégrés de population, est en fait quelque peu anti-climatique car elle implique une consolidation assez simple de deux sous-modèles ou plus, mais nous l'utiliserons pour nous concentrer sur les hypothèses, les conseils, les pièges et les meilleures pratiques pour le développement et l'interprétation des MIP.

Possibilités de carrière au sein du Service de la faune et de la flore : Que doivent vraiment savoir les étudiants et les professionnels en début de carrière pour réussir ?

Mardi 8 août, de 8h30 à 11h00 (ET)

Participant professionnel ou professionnel débutant : $10.00
Étudiant ou participant d'un pays spécial : $5.00

Nombre maximum de participants: 100

Instructeurs: J. Ryan Zimmerling (Service canadien de la faune), Natalie Savoie (Service canadien de la faune)

Cet atelier vise à fournir aux étudiants et aux professionnels en début de carrière les connaissances nécessaires pour décider s'ils souhaitent poursuivre une carrière au sein du Service de la faune et ce qu'ils doivent savoir pour réussir. L'atelier sera animé par des responsables du recrutement au sein du Service de la faune et comprendra une vue d'ensemble et un historique du Service de la faune, les types de carrières qui existent au sein du Service, où trouver les offres d'emploi et des conseils sur la manière de remplir les demandes d'emploi en ligne. Des informations seront également fournies sur la manière de se préparer et de réussir les examens écrits et les entretiens. Des conseils sur ce que les responsables du recrutement recherchent et sur les pièges à éviter seront également donnés au cours de cet atelier. Enfin, les participants recevront des informations sur le processus de candidature après l'emploi, ainsi que des conseils au début d'une nouvelle carrière. Un temps important sera consacré à une séance de questions-réponses à la fin de l'atelier.

La bioacoustique, un outil de recherche précieux

Mardi 8 août, de 9 h à 10 h 30 (heure de l'Est)

Participant professionnel ou professionnel débutant : $10.00
Étudiant ou participant d'un pays spécial : $5.00

Nombre maximum de participants: 30

Instructeur: Alexandra Donargo (Wildlife Acoustics)

Les enregistreurs acoustiques sans surveillance constituent une technique non invasive et rentable pour évaluer la présence des espèces dans une région. Les enregistrements acoustiques peuvent aider à déterminer les tendances des populations, à trouver des colonies inconnues et à répondre à d'autres questions de recherche pour soutenir les efforts de conservation. Cet atelier pratique enseignera aux participants les caractéristiques et les options de configuration des enregistreurs Song Meter SM4, Song Meter Mini et Song Meter Micro. Nous couvrirons tous les aspects de la préparation des enregistreurs en vue de leur déploiement. Nous entrerons dans les détails des réglages audio et couvrirons tous les aspects techniques que vous devez connaître au sujet de votre Song Meter SM4, Song Meter Mini ou Song Meter Micro pour garantir un déploiement réussi. Si le temps le permet, nous discuterons également des versions gratuites et payantes de notre logiciel Kaleidoscope qui permet une analyse efficace des données acoustiques.

Renforcer la diversité, l'équité, l'inclusion et l'accessibilité en ornithologie : Avons-nous déjà atteint notre but ?

Mardi 8 août, de 9h00 à 11h00 (heure de l'Est)

Participant professionnel ou professionnel débutant : $10.00
Étudiant ou participant d'un pays spécial : $5.00

Nombre maximum de participants: 50

Instructeurs: Personnel de l'Environnement pour les Amériques : Sheylda Díaz-Méndez, Carina Ruiz, Shanelle Thevarajah, Miguel Matta, Représentant des stagiaires

Nous explorerons le thème de la diversité, de l'équité, de l'inclusion et de l'accessibilité en ornithologie, depuis le recrutement jusqu'à la rétention dans les programmes de conservation. L'équipe partagera ses méthodes réussies dans un environnement accueillant et invitera les participants à apporter les leurs. Cette session abordera les besoins des étudiants sous-représentés, des professionnels internationaux et des professionnels en début de carrière, entre autres, y compris les obstacles présentés d'une manière attrayante tout en recommandant des méthodes efficaces pour diversifier un laboratoire, une équipe de terrain, un lieu de travail, des étudiants, et plus encore. La plupart des informations fournies seront issues des résultats de nos recherches sur le recrutement des stagiaires, les obstacles à la participation à des expériences de recherche sur le terrain, ainsi que de notre expérience sur notre lieu de travail et de notre expérience en matière de soutien aux stagiaires qui recherchent des opportunités inclusives.

Nos sessions incluront l'optique DEI&A, l'engagement des stagiaires culturellement, ethniquement et racialement diversifiés, des stages réussis pour un stagiaire neurodivergent, Out of Country : Impliquer l'expertise locale et renforcer les capacités, LGBTQ+ et sur le terrain, Petits pas vers l'inclusion : 10 conseils de nos stagiaires sur l'inclusion réussie, Reconnaître et traiter l'oppression dans les sciences, et Comment inclure et reconnaître le travail des ornithologues basés dans la région néotropicale. Les sessions consisteront en des présentations, des activités et des discussions individuelles sur des cas avec les participants.

Atelier 2023 du Comité de l'Atlas ornithologique de l'Amérique du Nord (NORAC)

Mardi 8 août, de 9h00 à 16h00 (heure de l'Est)

Participant professionnel ou professionnel débutant : $10.00
Étudiant ou participant d'un pays spécial : $5.00

Nombre maximum de participants: 30

Instructeurs: Julie Hart (coordinatrice de l'atlas des oiseaux nicheurs de New York), Gabriel Foley (coordinateur de l'atlas des oiseaux nicheurs du Maryland et du DC)

Depuis 1987, la Comité de l'atlas ornithologique de l'Amérique du Nord (NORAC) organise un atelier tous les deux à quatre ans lors des réunions de l'AM et/ou du CNA. Cependant, la dernière réunion a eu lieu il y a sept ans lors de la NAOC-VI. Depuis lors, des changements significatifs sont intervenus dans la méthodologie des atlas, liés aux changements d'échelle et de précision rendus possibles par des plateformes telles que eBird et NatureCounts. En conséquence, le NORAC a organisé une série de réunions virtuelles au début de l'année 2023 pour discuter des méthodes, des priorités et des objectifs à court terme pour les atlas modernes. Il en résulte une forte demande pour un format en personne afin de discuter des objectifs, des stratégies et des priorités à long terme des atlas. Ces discussions permettront de normaliser davantage la collecte des données de l'atlas des oiseaux et d'améliorer l'accessibilité et la flexibilité de l'un des ensembles de données scientifiques communautaires les plus vastes et les plus précis d'Amérique du Nord. La réunion de l'AM constitue une plateforme pour cette planification stratégique et l'établissement de futurs partenariats, puisque de nombreux membres du public cible assisteront déjà à la réunion. En outre, cet événement est l'occasion de collaborer et de former les coordinateurs d'atlas et les chercheurs. Les participants repartiront avec une meilleure compréhension de l'orientation des projets d'atlas, de la manière d'analyser les données de l'atlas et de la façon dont les ensembles de données peuvent être utilisés pour influencer la conservation de manière plus efficace.

Développer votre profil professionnel en ligne

Mardi 8 août, Heure 13:00-15:00 p.m. ET

Participant professionnel ou professionnel débutant : $10.00
Étudiant ou participant d'un pays spécial : $5.00

Nombre maximum de participants: 50

Instructeurs: Nandadevi Cortes (Ithaca College), Jared Elmore (Clemson University et National Bobwhite and Grasslands Initiative), Danielle Ethier (Oiseaux Canada), Sarah Gutowsky (Acadia University et Canards Illimités Canada), Jennifer Houtz (Cornell University), Steffi LaZerte (Brandon University), Lan-Nhi Phung (Penn State University), Natalie V. Sánchez (University of Windsor et Dry Forest Conservation Fund).

L'atelier consistera en de courtes présentations par des utilisateurs expérimentés, y compris des étudiants et des professionnels en début de carrière ayant une forte présence en ligne. Les participants se répartiront ensuite en petits groupes où ils pourront discuter des éléments de leur présence en ligne (par exemple, site web, Google Scholar, LinkedIn) avec chaque expert. Nous nous attacherons tout particulièrement à exposer les participants à une gamme variée de plateformes en ligne permettant de créer des profils professionnels en ligne, en fonction de leur domaine d'intérêt professionnel. Les participants auront l'occasion d'apprendre des trucs et astuces sur les différents aspects de leur profil en ligne, l'objectif étant que chaque participant reparte avec un plan personnalisé pour façonner sa présence en ligne.

Plus précisément, à l'issue de cet atelier, les participants seront en mesure de

• apprécier la valeur d'un profil en ligne cohérent et informatif
• apprécier quels sont les médias sociaux les plus utiles pour les professionnels et les différentes filières de carrière
• être au courant des différentes plates-formes de construction de sites Web disponibles
• disposer d'une liste de ressources pour la création de sites web
• ont élaboré en atelier un projet de biographie à publier sur ces sites
• ont reçu un retour d'information sur un profil ou un site web

Félicitations pour l'installation des stations Motus... et maintenant ?

Entretien, collecte de données et conseils de dépannage pour les stations de suivi de la faune et de la flore sauvages Motus

Mardi 8 août, de 13 h à 15 h (heure de l'Est)

Participant professionnel ou professionnel débutant : $10.00
Étudiant ou participant d'un pays spécial : $5.00

Nombre maximum de participants: 25

Instructeurs: Todd Alleger (Collaborateur Motus Nord-Est), Lucas Berrigan (Oiseaux Canada), Alison Fetterman (WCT, Collaborateur Motus Nord-Est), Jon Rice (Musée d'histoire naturelle Carnegie), Mallory Sarver (Musée d'histoire naturelle Carnegie), Aaron Coolman (WCT, Collaborateur Motus Nord-Est).

Le système de suivi de la faune Motus a révolutionné la façon dont nous enregistrons les mouvements des animaux dans la nature en utilisant une technologie de télémétrie radio VHF miniaturisée impliquant de minuscules émetteurs codés numériquement couplés à un réseau de stations de réception automatisées (ARS) en pleine expansion. Cet atelier s'adresse à ceux qui ont installé ou vont bientôt installer des stations de réception automatisées Motus. Nous montrerons comment rationaliser la maintenance et résoudre les problèmes courants avec les ARS. Nos discussions porteront sur les points suivants 1) les outils cartographiques de suivi de la maintenance des ARS (à l'aide d'Esri et des écosystèmes Google), 2) le protocole général de maintenance des stations et les ressources, et 3) les conseils de dépannage. En outre, maintenant que la station fonctionne, comment explorer, gérer et commencer à analyser les données collectées ? Notre discussion sur la stratégie de planification de projet comprend des moyens créatifs pour soutenir les frais de maintenance et de gestion des données de vos stations à l'avenir. Les participants repartiront en sachant comment assurer la maintenance de leur réseau ARS et la collecte de données au profit de tous ceux qui utilisent le réseau WTS.

Filtrage de la qualité des ensembles de données SNP à l'aide de R

Mardi 8 août, de 13 h à 16 h (heure de l'Est)

Participant professionnel ou professionnel débutant : $10.00
Étudiant ou participant d'un pays spécial : $5.00

Nombre maximum de participants: 15

Instructeur: Devon A. DeRaad (Université du Kansas)

Objectifs 1. Offrir aux participants la possibilité de rencontrer des collègues qui analysent également des données de séquences d'ADN et se posent des questions sur la génomique évolutive. 2. Faciliter l'expérience pratique de l'analyse des données SNP pour tous les participants. 3. Les participants avancés peuvent repartir avec un pipeline de filtrage SNP entièrement documenté, y compris des paramètres de filtrage optimisés pour un ensemble de données réel qu'ils ont l'intention de publier. Structure proposée 9:00-9:15AM Présentations des groupes, qui servent de brise-glace, ainsi qu'une opportunité de réseautage pour les participants (atteint l'objectif 1). 9:15-9:45 Introduction à l'atelier (courte conférence, sujets abordés : Next-gen sequencing, sources d'erreurs biologiques et techniques dans les données de séquence d'ADN, approches d'appel de génotype, introduction à RStudio et RMarkdown, et introduction aux paquets R vcfR et SNPfiltR). 9:45-10:15AM Les participants travaillent sur le tutoriel de filtrage SNP pré-conçu (atteint l'objectif 2). 10:15-10:30 Pause café et collation. 10:30-12:00 Session de travail de 90 minutes sur la bio-informatique pour que les participants continuent à suivre le tutoriel sur le filtrage des SNP. Je me promènerai constamment dans la salle de classe pour offrir mon soutien aux participants, ce qui pourrait aller du dépannage des installations de paquets R, à des conseils sur la façon de mettre en œuvre des seuils de filtrage optimaux ou à des discussions sur les nuances des ensembles de données empiriques des participants individuels. Les participants qui terminent le tutoriel sur le filtrage des SNP recevront des ressources supplémentaires montrant comment utiliser leurs ensembles de données filtrées comme données d'entrée pour les analyses génétiques et phylogénétiques des populations en aval (atteint l'objectif 3). Cet atelier est conçu pour que les participants puissent acquérir des compétences pertinentes quel que soit leur niveau d'expérience. Les participants seront encouragés à apporter un jeu de données SNP sur lequel ils travaillent actuellement ou à utiliser un jeu de données d'exemple que je fournirai. Pendant la session pratique, les participants moins expérimentés pourront passer du temps à installer les paquets R appropriés et à reconstruire un pipeline de filtrage standard en utilisant les données d'exemple. Pendant ce temps, les personnes plus expérimentées peuvent apporter leur propre jeu de données SNP empiriques, concevoir un pipeline de filtrage personnalisé basé sur les nuances de leurs données, et commencer à utiliser le jeu de données SNP filtrées de qualité qui en résulte comme entrée pour les analyses en aval. Je répondrai à l'ensemble des niveaux d'expérience en documentant minutieusement tout le matériel de l'atelier, y compris un tutoriel détaillé que les participants pourront suivre, dans un dépôt GitHub accessible au public (par ex, https://github.com/DevonDeRaad/Fall.2022.RAD.workshop). Comme ce matériel sera archivé en permanence, les participants pourront à tout moment renforcer le nouveau matériel qu'ils auront acquis pendant l'atelier, prolongeant ainsi la valeur de l'atelier au-delà d'une simple session autonome.

Application de l'explorateur de migration des oiseaux pour l'éducation, la recherche et la conservation

Mardi 8 août, de 13 h à 16 h (heure de l'Est)

Participant professionnel ou professionnel débutant : $10.00
Étudiant ou participant d'un pays spécial : $5.00

Nombre maximum de participants: 30

Instructeurs: Melanie A. Smith (National Audubon Society), Jill L. Deppe (National Audubon Society), Nathaniel E. Seavy (National Audubon Society), Chad J. Witko (National Audubon Society)

Les oiseaux migrateurs nous relient tous d'un bout à l'autre de l'hémisphère en jetant un pont entre les lieux et les cultures. Le Bird Migration Explorer est une plateforme interactive qui combine différents types de science de la migration pour visualiser les voyages de plus de 450 espèces d'oiseaux migrateurs d'Amérique du Nord. Il a été produit par Audubon avec neuf organisations partenaires et des centaines de chercheurs du monde entier. Le Bird Migration Explorer aide les utilisateurs à comprendre le cycle annuel complet des espèces migratrices et la connectivité entre les lieux, ainsi que les lacunes dans les connaissances scientifiques. En combinant l'empreinte des activités humaines et des changements environnementaux avec la distribution hebdomadaire des oiseaux, l'explorateur permet de visualiser les schémas où, quand et à quelle échelle les oiseaux sont exposés aux défis. 

Cet atelier formera les utilisateurs à la navigation dans l'explorateur et à l'interprétation des données et des cartes. Nous présenterons des cas d'utilisation pour des applications potentielles dans les domaines de l'éducation, de la recherche, de la conservation et de la défense des droits. Les participants viendront avec des idées sur la façon dont l'explorateur pourrait être utilisé dans leur travail et ces idées seront examinées avec les instructeurs en petits groupes. Enfin, les participants seront invités à contribuer au développement futur de l'Explorateur en indiquant quelles fonctionnalités supplémentaires pourraient les aider dans leur travail.